Hvis hjernen fungerer på en anden måde hos mennesker med autisme, så medfører det en anderledes tænkning og/eller sansning. Her ville det være praktisk hvis man kunne samle trådene og nå frem til een central, underliggende årsag til at mennesker med autisme har anderledes kommunikation, socialt samspil og forestillingsevne. Især to teorier er i fokus.

Theory of Mind

Små børn udvikler indenfor de første år en forestilling om at andre mennesker har et sind, der adskiller sig fra barnets eget. At de har deres egne tanker og hensigter og ser tingene fra deres egen vinkel. "Theory of mind"-teorien af Uta Frith går ud på at den forståelse ikke rigtig udvikles hos mennesker indenfor autismespektret. De vil med andre ord ikke kunne svare rigtigt i spørgsmålet i følgende billede. Det er Sally Anne testen.

Manglen på en veludviklet "theory of mind" skulle så medføre problemer med kommunikation, socialt samspil og forestillingsevne.

Central Coherence

er også Uta Friths teori. Den går ud på at mennesker med autisme ikke kan se skoven for træer. At de med andre ord ikke kan sortere i sanseindtrykkene og udvælge det der for normale mennesker er det centrale element. At de især hæfter sig ved detaljer. Hilde de Clerq har med udgangspunkt i sin egen søn skrevet en bog om denne teori. Bogen hedder "Mor, er det et menneske eller dyr".